Het Departement Bio-ingenieurswetenschappen zoekt veelbelovende talent voor een voltijdse

Doctoraatsbeurs in het domein Modellering van

plant-luchtvervuilingsinteracties in stedelijk milieu

Jouw opdracht

·          Je bereidt een doctoraal proefschrift voor in het domein van Modellering van de wederzijdse interacties tussen stedelijk groen en luchtverontreiniging;

·          Je neemt beperkte taken van onderwijs- en onderzoeksondersteuning op binnen de onderzoeksgroep Plantenproductie en Stresstolerantie (PeSTO) van het Departement Bio-ingenieurswetenschappen, Faculteit Wetenschappen;

·          Je dingt mee naar extern gefinancierde doctoraatsbeurzen.

Jouw profiel

·          Je bezit een diploma van Master in de Bio-ingenieurswetenschappen of aanverwant;

·          Je bent geïnteresseerd in modelleren en aanvullende veldexperimenten, en de (stedelijke) lucht-verontreinigingsproblematiek;

·          Je kan goede studieresultaten voorleggen;

·          Ook laatstejaarsstudenten kunnen zich kandidaat stellen;

·          Je legt in uw onderwijs de juiste accenten die passen binnen de UA visie op onderwijs ( http://www.ua.ac.be/onderwijs ) en assisteert actief bij de praktische oefeningen Plant Ecology en Fysische Ecologie;

·          Je onderzoekskwaliteiten sluiten aan bij de beleidslijnen van de universiteit ( http://www.ua.ac.be/onderzoek );

·          Je bent kwaliteitsgericht, integer, creatief en samenwerkingsgericht.

Wij bieden

·          Een doctoraatsbeurs voor een periode van twee jaar, eenmaal hernieuwbaar met twee jaar na positieve evaluatie;

·          De begindatum van de beurs is 1 oktober 2013;

·          Een dynamische en stimulerende onderzoeksomgeving.

Dit smaakt naar meer?

·          Je kan alleen online solliciteren en dit tot 9 juni 2013;

·          Er gebeurt een preselectie op basis van de ingediende kandidaturen; de verdere selectieprocedure is functiegericht en wordt door de selectiecommissie vastgesteld;

·          Voor informatie over het invullen van het sollicitatieformulier kunt u terecht bij Ellen Huijer (TEL 03 265 31 45) of Robin Wynants (TEL 03 265 31 41);

·          Met inhoudelijke vragen over de functie mag u contact opnemen met prof. Roeland Samson, e-mail:  roeland.samson@ua.ac.be , (TEL 03 265 34 37);

Het Departement Bio-ingenieurswetenschappen zoekt veelbelovende talent voor een voltijdse

Doctoraatsbeurs in het domein

Roetafbraak in lucht

Jouw opdracht

·          Je bereidt een doctoraal proefschrift voor in het domein van de studie van reactiemechanismen van geavanceerde oxidatieprocessen (fotokatalyse, plasmakatalyse, …) voor roetafbraak in relatie tot luchtpollutie;

·          Je neemt beperkte taken van onderwijs- en onderzoeksondersteuning op binnen de onderzoeksgroep DuEL, Departement Bio-ingenieurswetenschappen, Faculteit Wetenschappen;

·          Je dingt mee naar extern gefinancierde doctoraatsbeurzen.

Jouw profiel

·          Je bezit een diploma van Master in de Bio-ingenieurswetenschappen of aanverwant;

·          Je bent geïnteresseerd in luchtzuiveringsproblematiek en bezit een goede chemische achtergrondkennis;

·          Je kan goede studieresultaten voorleggen;

·          Ook laatstejaarsstudenten kunnen zich kandidaat stellen;

·          Je legt in uw onderwijs de juiste accenten die passen binnen de UA visie op onderwijs ( http://www.ua.ac.be/onderwijs );

·          Je onderzoekskwaliteiten sluiten aan bij de beleidslijnen van de universiteit ( http://www.ua.ac.be/onderzoek );

·          Je bent kwaliteitsgericht, integer, creatief en samenwerkingsgericht.

Wij bieden

·          Een doctoraatsbeurs voor een periode van twee jaar, eenmaal hernieuwbaar met twee jaar na positieve evaluatie;

·          De begindatum van de beurs is 1 oktober 2013;

·          Een dynamische en stimulerende onderzoeksomgeving.

Dit smaakt naar meer?

·          Je kan alleen online solliciteren en dit tot 9 juni 2013;

·          Er gebeurt een preselectie op basis van de ingediende kandidaturen; de verdere selectieprocedure is functiegericht en wordt door de selectiecommissie vastgesteld;

·          Voor informatie over het invullen van het sollicitatieformulier kunt u terecht bij Ellen Huijer (TEL 03 265 31 45) of Robin Wynants (TEL 03 265 31 41);

·          Met inhoudelijke vragen over de functie mag u contact opnemen met prof. Silvia Lenaerts, e-mail:  silvia.lenaerts@ua.ac.be , (TEL 03 265 36 84);

De Universiteit Antwerpen werkt mee aan een open, democratische en multiculturele samenleving. Wij voeren een gezinsvriendelijk en een gelijkekansenbeleid.

Het Departement Bio-ingenieurswetenschappen zoekt veelbelovende talent voor een voltijdse

Doctoraatsbeurs in het domein

Urbane microbiologie

Jouw opdracht

·          Je bereidt een doctoraal proefschrift voor rond het voorkomen van bacteriën in stedelijk milieu en hun effecten op het immuunsysteem in relatie tot luchtverontreiniging;

·          Je neemt beperkte taken van onderwijs- en onderzoeksondersteuning op binnen de onderzoeksgroep Plantenproductie en Stresstolerantie (PeSTO) van het Departement Bio-ingenieurswetenschappen, Faculteit Wetenschappen;

·          Je dingt mee naar extern gefinancierde doctoraatsbeurzen.

Jouw profiel

·          Je bezit een diploma van Master in de Bio-ingenieurswetenschappen of aanverwant;

·          Je bent geïnteresseerd in microbiologie en effecten van verstedelijking zoals luchtvervuiling;

·          Je kan goede studieresultaten voorleggen;

·          Je legt in uw onderwijs de juiste accenten die passen binnen de UA visie op onderwijs ( http://www.ua.ac.be/onderwijs );

·          Je onderzoekskwaliteiten sluiten aan bij de beleidslijnen van de universiteit ( http://www.ua.ac.be/onderzoek );

·          Je bent kwaliteitsgericht, integer, creatief en samenwerkingsgericht.

Wij bieden

·          Een doctoraatsbeurs voor een periode van twee jaar, eenmaal hernieuwbaar met twee jaar na positieve evaluatie;

·          De begindatum van de beurs is 1 januari 2014;

·          Een dynamische en stimulerende onderzoeksomgeving.

Dit smaakt naar meer?

·          Je kan alleen online solliciteren en dit tot 9 juni 2013;

·          Er gebeurt een preselectie op basis van de ingediende kandidaturen; de verdere selectieprocedure is functiegericht en wordt door de selectiecommissie vastgesteld;

·          Voor informatie over het invullen van het sollicitatieformulier kunt u terecht bij Ellen Huijer (TEL 03 265 31 45) of Robin Wynants (TEL 03 265 31 41);

·          Met inhoudelijke vragen over de functie mag u contact opnemen met prof. Sarah Lebeer, e-mail: sarah.lebeer@ua.ac.be , (TEL 03 265 32 85).

De Universiteit Antwerpen werkt mee aan een open, democratische en multiculturele samenleving. Wij voeren een gezinsvriendelijk en een gelijkekansenbeleid.

Het Departement Biologie zoekt een veelbelovend talent voor een voltijdse

Doctoraatsbeurs

in het domein Plantenecologie en vegetatie-ecologie

Jouw opdracht

·         Dit doctoraatsproject richt zich op de studie van de respons van ecosystemen en vegetaties op klimaatextremen, incl. de modellering van deze respons met het oog op voorspelling;

·         Je bereidt een doctoraal proefschrift voor in het domein van de plantenecologie, meer bepaald m.b.t. de effecten van klimaatextremen (droogte, hitte, …) op vegetaties en ecosystemen;

·         Je neemt beperkte taken van onderwijs-  en onderzoeksondersteuning op binnen het Departement Biologie/ Faculteit Wetenschappen/ onderzoeksgroep Planten en Vegetatie-ecologie.

Jouw profiel

·         Je bezit een diploma van Master/Licentiaat in de Biologie, Bio-ingenieurswetenschappen, met een sterke interesse in de ecologie en/of milieustudies;

·         Je kan uitstekende studieresultaten voorleggen;

·         Ook laatstejaarsstudenten kunnen zich kandidaat stellen;

·         Je legt in uw onderwijs de juiste accenten die passen binnen de UA visie op onderwijs ( http://www.ua.ac.be/onderwijs ) en assisteert actief bij de praktische oefeningen Plant Ecology en Fysische Ecologie;

·         Je onderzoekskwaliteiten sluiten aan bij de beleidslijnen van de universiteit ( http://www.ua.ac.be/onderzoek );

·         Je bent kwaliteitsgericht, integer, creatief en samenwerkingsgericht;

·         Terreinervaring met ecologische studies is een pluspunt.

Wij bieden

·         Een doctoraatsbeurs voor een periode van twee jaar, eenmaal hernieuwbaar met twee jaar na positieve evaluatie;

·         De begindatum van de beurs is 1 oktober 2013;

·         Een dynamische en stimulerende onderzoeksomgeving.

Dit smaakt naar meer?

·         Je kan alleen online solliciteren en dit tot 10 juli 2013;

·         Er gebeurt een preselectie op basis van de ingediende kandidaturen; de verdere selectieprocedure is functiegericht en wordt door de selectiecommissie vastgesteld;

·         Voor informatie over het invullen van het sollicitatieformulier kunt u terecht bij Ellen Huijer (TEL 03 265 31 45) of Robin Wynants (TEL 03 265 31 41);

·         Met inhoudelijke vragen over de functie mag u contact opnemen met prof. Reinhart Ceulemans, ( reinhart.ceulemans@ua.ac.be of TEL 03 265 22 56).

De Universiteit Antwerpen werkt mee aan een open, democratische en multiculturele samenleving. Wij voeren een gezinsvriendelijk en een gelijkekansenbeleid.

The Biomolecular Mass Spectrometry group (BMS) is a multidisciplinary team in the Department of Chemistry/Center for Proteomics (Faculty of Sciences) at the University of Antwerp/Belgium. We are looking for a highly motivated

PhD student

Description:

The BMS group (Prof. Frank Sobott) recently received funding for a collaborative center which will investigate dynamic protein structures and interactions by different spectroscopic techniques.
The collaboration involves groups from different departments which use mass spectrometry, laser spectroscopy and biochemical/biophysical characterization to investigate “Protein structures in 4D” of biomedical interest.

You will be developing the experimental methods further, in particular based on mass spectrometry, and collaborate with the other groups and work on a variety of aspects of protein characterization. You will also prepare a doctoral thesis in the field of Protein Mass Spectrometry/Structural Biology, and contribute to teaching in the Sciences.

Profile and requirements

·         You hold a master’s degree in Chemistry or Physics, or perhaps Biochemistry; students in the final year of their degree can also apply;

·         You ideally have some prior experience in either mass spectrometry, (bio)physical chemistry, spectro­scopy or structural biology;

·         You have a strong interest in applying these techniques to molecules of biological interest;

·         You can manage your own research and submit outstanding academic results;

·         You can communicate well in English (written and spoken);

·         Your academic qualities comply with the requirements stipulated in the university’s policy ( http://www.ua.ac.be/research );

·         You are prepared to apply for external funding of your project via Belgian funding bodies;

·         You are quality-oriented, conscientious, creative, and cooperative.

We offer

·         A doctoral scholarship for an initial period of 1 year, which can be extended to 4 years after a positive evaluation;

·         An exciting project at the interface of Physical and Life Sciences, in an international and multi-disciplinary context;

·         The start date of the scholarship will be October 1^st 2013, or at an earlier date as agreed;

·         A very competitive monthly salary;

·         A dynamic and stimulating work environment;

·         Life in an attractive, international city at the heart of Europe.

Interested?

·         Applications to be submitted online;

·         Include your curriculum vitae, a motivation letter and the names and contact information for at least two references;

·         For questions about the profile and the description of duties, please feel free to contact Prof. Frank Sobott (frank.sobott@ua.ac.be).

The Biomolecular Mass Spectrometry group (BMS) is a multidisciplinary team in the Department of Chemistry/Center for Proteomics (Faculty of Sciences) at the University of Antwerp/Belgium. We are looking for a highly motivated

Postdoctoral Researcher

Description:

The BMS group (Prof. Frank Sobott) develops and uses methods based on native mass spectrometry and ion mobility to investigate large noncovalent assemblies of (bio-)molecules. Current topics in-clude protein conformational studies and the assembly, architecture and dynamics of DNA-regulating enzymes. We also develop and modify instrumentation in collaboration with manufacturers. The lab has a Synapt G2 (with ETD) and a high-mass Q-Tof2 and will acquire a customized Synapt G1 for the purpose of this project.

The Center for Proteomics has recently been established as a collaborative platform at the University of Antwerp. It comprises several groups which work in the areas of LC-MS analysis and proteomics. The Center has a wide range of state-of-the-art equipment, including an Orbitrap Velos (with ETD and FAIMS), 4800 MALDI TOF/TOF, triple quad and ion trap instruments, as well as Nanomate inlet devices, 1D and 2D LC/nano-LC, and extensive bioinformatics support.

The candidate will be employed to lead efforts in a large, EU-funded collaboration on the structure and assembly of histone-regulating enzyme complexes, using non-denaturing mass spectrometry and ion mobility approaches.

Profile and requirements

·         You hold a PhD in Chemistry or Physics, or perhaps Biochemistry;

·         You have prior experience in biological mass spectrometry;

·         Knowledge of (bio)physical chemistry, spectroscopy or structural biology would be a bonus;

·         You can manage your own research and submit outstanding academic results;

·         You can communicate well in English (written and spoken);

·         Your academic qualities comply with the requirements stipulated in the university’s policy (http://www.ua.ac.be/research);

·         You are willing to apply for an independent postdoctoral fellowship;

·         You are quality-oriented, conscientious, creative, and cooperative.

We offer

·         An appointment as a postdoctoral researcher for a period of one year, with a possibility for extension of 2 years;

·         An exciting project at the interface of Physical and Life Sciences, in an international and multi-disciplinary context;

·         The date of appointment will be as soon as possible;

·         A very competitive monthly salary;

·         A dynamic and stimulating work environment;

·         Life in an attractive, international city at the heart of Europe.

Interested?

·         Applications to be submitted online;

·         Include your curriculum vitae, publication list, a motivation letter and the names and contact information for at least two references;

·         For questions about the profile and the description of duties, please feel free to contact Prof. Frank Sobott (frank.sobott@ua.ac.be).

Het Vlaams Supercomputer Centrum ondersteunt de HPC activiteiten aan de Vlaamse universitaire associaties (vscentrum.be). Binnen de kernfaciliteit "CalcUA Supercomputing" van de Universiteit Antwerpen (calcua.ua.ac.be) is volgende voltijdse functie (m/v) vacant:

Analist HPC

Opdracht

·        Je staat mee in voor de eerstelijnshulp, je adviseert en ondersteunt onderzoekers bij het gebruik van gespecialiseerde software en bij het aanpassen en ontwikkelen van code (gebruik van MPI, OpenMP e.d. en optimaliseren voor specifieke hardware);

·        Je informeert, sensibiliseert en trekt mee nieuwe gebruikers aan, zowel binnen de associaties, onderzoekscentra als bedrijven;

·        Je ontwikkelt mee cursusmateriaal, samen met VSC collega’s en externe specialisten, zodat onderzoekers de infrastructuur optimaal kunnen gebruiken en je geeft ook zelf cursussen;

·        Je inventariseert de noden en adviseert uitbreidingen en updates.

Profiel

·        Je beschikt over een doctoraat of masterdiploma in de wetenschappen of toegepaste wetenschappen in een studierichting met een uitgebreid informaticaprogramma;

·        Je hebt ervaring in het wetenschappelijk rekenen en het gebruik van wetenschappelijke programmatuur, zowel als eindgebruiker als ontwikkelaar;

·        Je hebt een duidelijke interesse in computationele problemen, ook buiten de (toegepaste) wetenschappen (bv. economie, geneeskunde, sociologie, taalkunde) en je hebt uitgebreide programmeerervaring;

·        Aangezien je in een academische omgeving werkt, verwachten we een bepaalde affiniteit met het wetenschappelijk onderzoek;

·        Je hebt belangstelling voor dienstverlening en je beschikt over uitstekende communicatieve vaardigheden in het Engels, kennis van het Nederlands strekt tot de aanbeveling;

·        Je bent flexibel, verantwoordelijk en zelfstandig in de uitvoering van je werk, maar je functioneert eveneens uitstekend in groep.

Wij bieden

We bieden een voltijdse tewerkstelling vanaf 1 juli 2013 of een latere datum in onderling overleg, voor een periode van 1 jaar, mogelijk verlengbaar.

Sollicitatieprocedure

Er zal een preselectie gebeuren op basis van de sollicitatiebrief, de aanbevelingsbrieven en het CV.  De geselecteerde kandidaten worden nadien uitgenodigd voor proeven en/of een sollicitatiegesprek.

Hoe kandideren?

De sollicitatiebrief, 2 aanbevelingsbrieven en CV dienen uiterlijk op 30 april 2013 in het bezit te zijn van de Universiteit Antwerpen t.a.v. Prof. Annie Cuyt, Departement   Wiskunde en Informatica, Middelheimlaan 1, 2020 Antwerpen

Meer info:

Voor bijkomende informatie over deze functie kan u terecht bij Prof. Annie Cuyt, tel. +32 3 265 3898 / +32 3 265 3860 of Annie.Cuyt@ua.ac.be.

Binnen het departement Fysica van de Universiteit Antwerpen, in het Laboratorium voor Experimentele Fysica van de Gecondenseerde Materie is volgende vacature vacant:
 
Doctoraatsstudent voor FWO project: Karakterisering van Organische Niet-Lineair Optische Materialen met Automatische Golflengte-Regeling
 
Project
Organische geconjugeerde moleculen kunnen, dankzij hun erg polariseerbare elektronen-systeem, een opmerkelijk sterke niet-lineair optische (NLO) respons vertonen die veelbelovend is voor toepassingen als ultrasnelle lichtmodulatoren en -schakelaars voor optische telecommunicatie. Met behulp van een wereldwijd unieke meetopstelling voor tweede harmonische lichtverstrooiing met regelbare lasergolflengte onderzoekt u de oorsprong van deze niet-lineaire respons, en zijn uitgesproken resonanties in het zichtbare en nabij-infrarode spectrum. U draagt ook bij aan de verdere ontwikkeling en automatisering van de opstellingen, o.m. mogelijk gemaakt dankzij een nieuw, volledig computergestuurd lasersysteem gefinancierd in het kader van dit project. De meetresultaten vormen de basis voor theoretische modellen (ook i.s.m. theoriegroepen) en structuur-eigenschapsrelaties die u toelaten om nieuwe moleculen en materialen te ontwerpen (in nauwe samenwerking met diverse chemische synthesegroepen in binnen- en buitenland) met geoptimaliseerde NLO eigenschappen. De tweede orde lichtverstrooiingsspectroscopie (incoherente tweede-harmonische lichtverstrooiing), die dank zij de automatisering op zeer diverse stalen kan toegepast worden, levert ook fundamenteel nieuwe inzichten in de elektronische en vibronische structuur van organische moleculaire systemen in het algemeen.
 
Uw profiel

• Je behaalde een diploma van Master in de Fysica, Scheikunde, of Burgerlijk/Industrieel Ingenieur in een aanverwante richting (bv. Chemie/Materialen, Natuurkunde, Fotonica, ...), en behaalde goede studieresultaten;
• Je bent bijzonder gemotiveerd voor experimenteel wetenschappelijk onderzoek, en wenst hierin een doctoraat voor te bereiden;
• Ook indien u geïnteresseerd bent en uw diploma nog niet behaald hebt, maar plant dit dit jaar te behalen, gelieve dan zo snel mogelijk contact op te nemen.

Wij bieden

• Een doctoraatsbeurs voor 4 jaar in het kader van bovenvernoemd FWO-project;
• Startbedrag van de beurs is € 2.124,11;
• De gelegenheid om onderzoek uit te voeren in de multidisciplinaire omgeving van, en begeleid door, een jong, dynamisch, en snelgroeiend onderzoeksteam met een zeer uitgebreid arsenaal aan hoogtechnologische experimentele onderzoeksinfrastructuur;
• Naast uw beurs omvat dit specifieke FWO-project ook financiering voor apparatuur en werking (totaal budget 397 000 €), en u kunt uiteraard ook gebruik maken van 
  apparatuur gefinancierd in het kader van diverse andere (voorgaande en lopende) projecten;
• Startdatum van de beurs is 2013 (precieze startdatum in overleg met de kandidaat te bepalen) 

Geïnteresseerd

• Stuur je sollicitatiebrief met CV en eventuele referenties naar Wim.Wenseleers@ua.ac.be, met vermelding van "VacNLO2013" als onderwerp.
• Promotoren: Wim Wenseleers en Jochen Campo
• Voor meer informatie: Wim.Wenseleers@ua.ac.be
   

The Faculty of Sciences is seeking to fill the following full-time vacancy in the Evolutionary Ecology Group of the Department of Biology:

Doctoral student in Ecology

Evolutionary Ecology of nest-parasite communities in cavity-nesting birds

Despite the multitude of studies on nestbox-breeding birds, surprisingly little attention has been paid to host-parasite interactions, and to nest parasites in particular. Moreover, most studies have focused on single parasite species without considering interactions among different parasite species or factors governing parasite diversity. Aside from their relevance to their bird hosts, nest parasites can also be studied as ecological communities in their own right. Thanks  to their highly standardized conditions and amenability to field experiments with a high degree of spatial replication, nestboxes can be regarded as semi-natural mesocosms that can be used for investigating topics such as interspecific interactions, dispersal and environmental gradients such as urbanization. The present project originated as part of an inter-university, multi-taxon research project on eco-evolutionary dynamics along a single urbanization gradient in Belgium (“SPEEDY”), including communities ranging from birds to plants to aquatic zooplankton .  The project is also embedded in a long-term research programme on population dynamics and evolutionary ecology of cavity-nesting birds.

The specific objectives of this PhD project are (1) to describe variation in species richness, community structure and functional diversity of parasites and commensal species  inhabiting nests of great tits (Parus major)alongan urbanization gradient in Belgium; (2) to study the impact of parasite communities on host fitness, using demographic data collected in an ongoing population study; (3) to study how prevalence and abundance of parasite species are affected by ecological interactions within the nest (competition, mutualism, predation) and how these interactions vary along the urbanization gradient; and (4) to analyze the potential for evolutionary change along this gradient by studying variation at genotypic (using neutral markers) and phenotypic level (life history traits, virulence- and dispersal-related traits) for one or more parasite species.

Profile and requirements

·         You hold a Master degree in Biology or comparable with a strong background in ecology and evolutionary biology;

·         You can submit outstanding academic results;

·         You have a solid training in both uni- and multivariate statistical analysis;

·         Experience with parasite research, entomology and/or community ecology is an advantage;

We offer

·         A doctoral scholarship for a period of two years, with the possibility of renewal for a further two-year period after positive evaluation;

·         The starting date of the scholarship will be April 1^st 2013;

·         You will enrol in the Antwerp Doctoral School training program ( www.ua.ac.be/ads ) allowing you to take part in various courses, training programs and conferences within and outside the university;

·         You will work in a team of several PhD students, postdocs and technical staff involved in eco-evolutionary research on birds and bird parasites;

·         You will be member of the Evolutionary Ecology group, a dynamic and internationally-oriented research group that combines field, lab and modelling approaches to study various questions in ecological and evolutionary research, mainly focusing on birds and mammals ( www.ua.ac.be/eveco ).

Interested?

·         Applicants should send their complete CV, a one-page statement of research interests and motivation for this project, and contact information of two referees who can supply letters of recommendation upon our request;

·         Applications should be submitted by email to Prof. Erik Matthysen at erik.matthysen@ua.ac.be until the closing date: 20 January 2013;

·         For more information, contact Erik Matthysen at the same email adress or at (+32) 3265 3464

The University of Antwerp strives to contribute to an open, democratic and multi-cultural society. We follow an equal-opportunity policy.

The Faculty of Sciences is seeking to fill the following full-time vacancy in the Department of Mathematics and Computer Science

Doctoral researcher in the field of data mining for proteomics

The Advanced Database Research and Modelling (ADReM) research group of the department of Mathematics and Computer Science is a leading group in both Belgian and European data mining. It is one of the founding members of Biomina (biomedical informatics research center Antwerp), a new interdisciplinary research unit for biomedical informatics established by the University of Antwerp and the Antwerp University Hospital that aims to address the growing needs of biomedical data processing and to enable new interdisciplinary cross-fertilization. This position is situated in the context the IWT-SBO project “inspector: an integrated informatics platform for mass spectrometry-based protein assays”. The candidate will conduct research to develop new data mining and machine learning algorithms supporting “mass-spectrometry based proteomics (MS proteomics)”. MS proteomics is a powerful and promising domain for biotechnology and hospital, but the enormous complexity of its data requires novel, robust data processing techniques.

Job description

Your focus will be on algorithm development, performance evaluation and software prototyping. In collaboration with bioinformaticians your newly developed methods will be embedded in a user-friendly software environment and application-programming interface. You prepare a doctoral thesis in data mining. You collaborate with researchers in different disciplines (from computational sciences to life sciences) within the consortium (UA, VIB-UGent, Vito and KULeuven) and with (mainly biotech) companies of the project user committee.

Profile and requirements

·         You have a master degree in Computer Sciences, Mathematics, Physics, (software) engineering or equivalent, with outstanding study results;

·         Profound programming skills (C++, Java, Python) and familiarity with relational databases (MySQL) are required. Experience with statistical / mathematical software (R, Matlab) is a plus. You have a strong quantitative background;

·         You are strong in interdisciplinary English communication, quality-oriented and creative, and eager to emerge in new scientific disciplines;

·         Previous experience in data mining, p rotein bioinformatics, mass spectrometry or other ‘omics techniques is a plus.

We offer

·         An exciting research opportunity to complete a PhD;

·         A doctoral scholarship for a period of two years, with the possibility of renewal for a further two-year period after positive evaluation. The default start date of the scholarship will be March 1^st 2013;

·         A dynamic, stimulating and multinational work environment.

Interested?

Applications are invited to send a motivation letter, a detailed CV (including courses, grades, previous work, publications) and contact info of at least two references (including email addresses and phone numbers) to Prof. Kris Laukens ( kris.laukens@ua.ac.be ). Don’t hesitate to contact us in advance for more information.

The Faculty of Sciences of the University of Antwerp, in collaboration with the Flemish Institute for Technological Research (VITO), is seeking to fill the following full-time vacancy in the Department of Mathematics and Computer Science.

Post-doctoral researcher in the field of data mining for proteomics

The research will be conducted within the Advanced Database Research and Modelling (ADReM) lab of the UA department of Mathematics and Computer Science, and within the UA/Vito Center for Proteomics. ADReM is a leading group in European data mining research. The Center for Proteomics (CFP) is a joint research center funded and operated by VITO and the University of Antwerp. CFP incorporates academic research based on mass spectrometry and related techniques, as well as applications in a wide range of biomedical areas. This position is situated in the context of the IWT-SBO project “inspector: an integrated informatics platform for mass spectrometry-based protein assays”. The candidate will conduct research to develop new data mining and machine learning algorithms supporting “mass-spectrometry based proteomics (MS proteomics)”. MS proteomics is a powerful and promising domain for biotechnology and hospital, but the enormous complexity of its data requires novel, robust data processing techniques.

Job description

You will perform research on the development of novel data mining and machine learning techniques, with a focus on translating the challenges of MS proteomics data processing into novel algorithms and data processing workflows. You will work closely with domain experts to understand the data and its particular problems, and you will supervise their applicability in a real laboratory setting. In collaboration with bioinformaticians these newly developed methods will be embedded in a user-friendly software environment and application-programming interface. You co-supervise PhD students working in this and related projects. You collaborate with researchers in different disciplines (from computational sciences to life sciences) within the consortium (UA, VIB-UGent, Vito and KULeuven) and with (mainly biotech) companies of the project user committee.

Profile and requirements

·         You have a doctoral degree in (applied) data mining, bioinformatics or chemoinformatics with an excellent publication track record;

·         You are strong in interdisciplinary English communication, quality-oriented and creative, and eager to emerge in new scientific disciplines. Proven people and project management skills and ability to attract research funds are a plus;

·         Previous experience in p rotein bioinformatics, mass spectrometry or other ‘omics techniques is an advantage.

We offer

·         A postdoctoral research position for a period of two years, with the possibility of renewal after positive evaluation. The default start date of the position is March 1^st 2013;

·         A salary commensurate with your experience and academic qualifications;

·         A dynamic, stimulating and multinational work environment.

Interested?

Candidates are invited to send a motivation letter, a detailed CV (including courses, grades, previous work, publications) and contact info of at least two references (including email addresses and phone numbers) to Prof. Kris Laukens ( kris.laukens@ua.ac.be ) and Prof. Dirk Valkenborg ( dirk.valkenborg@vito.be ). Don’t hesitate to contact us in advance for more information.

2 predoc positions in the field of quantitative X-ray computed tomography for food processing

Description:

The Vision Lab ( http://www.visielab.ua.ac.be/ ) is a dynamic research group of the physics department at the University of Antwerp. The Vision Lab has unique expertise in the development of tomographic image reconstruction, processing and analysis methods.  Application domains are Computed tomography, Magnetic Resonance Imaging and Electron Tomography.

The current position involves the development of 1) discrete tomography and 2) neural networks for X-ray computed tomography in food processing.

Your profile:

·        You have a master degree in Computer Science, Physics, Mathematics, Applied sciences;

·        You have a strong background in mathematics and interest in scientific research;

·        You have profound programming skills in C++ and/or Matlab;

·        You have excellent communication skills (English);

·        You want to work in a team of researchers on the topic of model based image reconstruction.

Our offer:

·        An exciting research trajectory towards a PhD;

·        Multidisciplinary research: cooperation with academic research groups (Univ. Antwerp, KU Leuven, Amsterdam)  and industrial partners;

·        Top-computer infrastructure;

·        Competitive salary

Applications:

Interested candidates are invited to send

·        A motivation letter

·        A detailed CV (including followed courses, grades, previous work, publications,  …

·        Contact info of at least two references

to Karen Dierckxsens  ( karen.dierckxsens@ua.ac.be ) with Prof Sijbers ( jan.sijbers@ua.ac.be ) in copy.

Prof. Dr. Jan Sijbers

University of Antwerp

Universiteitsplein 1

Campus Drie Eiken, N.1.13

B-2610 Antwerp, Belgium

Email: jan. sijbers@ua.ac.be

http://visielab.ua.ac.be/staff/sijbers/