Functionele genoomanalyse

Academiejaar: 2010-2011 Code opleidingsonderdeel: 1MBIC-V-004 Semester: 2e semester Studiepunten: 3 Uren Studietijd: 84 Uren theorie: 20,00 Uren praktijk: Uren andere: Deeltijds programma: 2 Titularis(sen) Marc Cruts Taal waarin de cursus wordt gedoceerd: Nederlands Info semesterexamen: Info contractrestrictie: 1. Aanvangscompetenties (begintermen) *Algemene competenties De student is vertrouwd met de basis van moleculaire biologie en genetica. De student beheerst de klassieke principes en toepassingen van de gentechnologie en heeft kennis van bio-informatica. *Volgtijdelijkheid algemene voorwaarden voorkennis Ma : geen Ba1 en Ba2-vakken in GT met de master, maximum 18 studieptn van Ba3 in GT, credit behaald hebben voor de Ba-scriptie. Verplicht opnemen van : 'Gen- en genoomtechnologie' en 'Eiwittechnologie en proteoomanalyse'. 2. Eindcompetenties (eindtermen) De student kent de anatomie van het genoom, met inbegrip van algemene organisatie, genen en repetitief DNA. Hij/zij kan grote genomen in kaart brengen en de sequentie ervan bepalen en annoteren met functionele elementen. De student is vertrouwd met de principes van moderne grootschalige genomische analysetechnologieën. 3. Inhoud Structurele genoomanalyse - genoomcomplexiteit, en –structuur met nadruk op humaan genoom - in kaart brengen en sequentiebepaling van grote genomen - DNA-herschikkingen in mensgenoom - functionele annotatie van genoomsequenties in functie van transcriptie, transcriptieregulatie, DNA-replicatie en evolutie   Comparatieve genoomanalyse - definitie en toepassingen - genfamilies - synteny mapping en functionele gen-annotatie             Functionele genoomanalyse - transcriptoomanalyse - comprehensive mutant libraries 4. Werkvormen Contactmomenten: Hoorcolleges 5. Evaluatievormen Examen: Mondeling met schriftelijke voorbereiding Gesloten boek Open vragen Permanente evaluatie: Medewerking tijdens de contactmomenten 6. Noodzakelijk studiemateriaal De cursus, in de vorm van ppt presentaties, wordt beschikbaar gesteld aan de student. 7. Facultatief studiemateriaal Geen 8. Studiebegeleiding De docent is beschikbaar voor vragen voor, tijdens en na de contactmomenten. laatste aanpassing: laatste aanpassing: 10/11/2009 14:10 kim.tote